免疫檢查點(diǎn)抑制劑等免疫療法的成功應(yīng)用，表明免疫系統(tǒng)可以成功地利用其進(jìn)行有效的抗癌治療。但由于只有某些癌癥類型或某癌癥類型內(nèi)的一部分患者可以對(duì)免疫療法產(chǎn)生反應(yīng)，因此基于每種腫瘤類型的免疫環(huán)境進(jìn)行合理的患者選擇對(duì)于獲得最佳獲益至關(guān)重要。

    為更好地了解血液癌癥的生物學(xué)特性以及發(fā)現(xiàn)潛在的免疫治療策略，芬蘭研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)追蹤了多發(fā)性骨髓瘤、淋巴瘤、白血病等血液系統(tǒng)惡性腫瘤中發(fā)生的免疫變化。研究團(tuán)隊(duì)將涉及36種血液癌癥類型的8,000多個(gè)轉(zhuǎn)錄組和2,000個(gè)癌癥樣本的基因多組學(xué)數(shù)據(jù)整合在一起，分析了免疫學(xué)特征如何與癌癥亞型、遺傳和表觀遺傳學(xué)改變以及患者生存率相關(guān)聯(lián)，并通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了主要發(fā)現(xiàn)。近日，該研究成果發(fā)表在Cancer Cell，文章題為“Immunogenomic Landscape of Hematological Malignancies”。該研究將免疫學(xué)與血液惡性腫瘤中的癌癥亞型和基因組學(xué)聯(lián)系起來(lái)，為相關(guān)研究提供了豐富的資源。 

    赫爾辛基大學(xué)血液學(xué)和轉(zhuǎn)化免疫學(xué)研究員Satu Mustjoki與東芬蘭大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究員Merja Heinaniemi共同領(lǐng)導(dǎo)了該研究。借助針對(duì)Hemap基因表達(dá)資源（一個(gè)表征血液惡性腫瘤分子表型的交互式在線資源）的細(xì)胞類型分類和未分類樣本生成的基于陣列的基因表達(dá)譜，研究人員分析了跨越36種血液癌癥類型的8472個(gè)樣本的轉(zhuǎn)錄組，并將它們與629個(gè)正常血液樣本和530個(gè)細(xì)胞系樣本進(jìn)行比較，以全面分析血液癌癥轉(zhuǎn)錄組的免疫學(xué)特性。同時(shí)，研究團(tuán)隊(duì)還通過(guò)RNA測(cè)序和單細(xì)胞RNA-seq實(shí)驗(yàn)，驗(yàn)證了100多種急性髓樣白血病（AML）和MDS樣本中的免疫、表觀遺傳和腫瘤相互作用。研究團(tuán)隊(duì)分析了包含體細(xì)胞突變、拷貝數(shù)、表達(dá)、甲基化、臨床等多組學(xué)數(shù)據(jù)，以及針對(duì)癌癥基因組圖譜、CoMMpass、BeatAML和其他項(xiàng)目的近2400例彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤、AML、多發(fā)性骨髓瘤或相關(guān)細(xì)胞系樣本數(shù)據(jù)。

研究概要圖

    該研究確定了免疫浸潤(rùn)和免疫排斥的癌癥之間的微環(huán)境和遺傳差異，并證明了表觀遺傳組成與抗原呈遞之間的聯(lián)系。在以TP53突變?yōu)闃?biāo)志的MDS相關(guān)AML病例中，研究發(fā)現(xiàn)了細(xì)胞毒性T細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞浸潤(rùn)的跡象。在活化的B細(xì)胞樣彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤中，似乎增強(qiáng)了細(xì)胞溶解性淋巴細(xì)胞的浸潤(rùn)，盡管該淋巴瘤傾向于干擾素-γ相關(guān)的免疫信號(hào)。

不同免疫環(huán)境與淋巴瘤和白血病中的細(xì)胞溶解浸潤(rùn)有關(guān)

    研究團(tuán)隊(duì)在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中進(jìn)行了甲基化模式分析，發(fā)現(xiàn)甲基化變化可抑制AML中的HLA基因并誘導(dǎo)骨髓瘤中的癌癥抗原。包括基因表達(dá)數(shù)據(jù)在內(nèi)的綜合分析則指向了可能適用于某些癌癥類型的免疫靶標(biāo)。例如，在髓樣惡性腫瘤中，分析顯示含有VISTA蛋白的免疫檢查點(diǎn)的表達(dá)增強(qiáng)，其他腫瘤條件下PD-L1或CD70免疫檢查點(diǎn)的表達(dá)更為明顯。該研究表明基因組和微環(huán)境因素與不同腫瘤之間免疫狀況的變化有關(guān)。研究結(jié)果強(qiáng)調(diào)了整合免疫領(lǐng)域不同方面的遺傳、表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)以及腫瘤微環(huán)境的的必要性，有助于全面了解可能影響免疫療法反應(yīng)的潛在決定因素。研究發(fā)現(xiàn)的相關(guān)特征為患者的治療和生存提供了線索，支持了將免疫學(xué)特性以及遺傳和表觀遺傳學(xué)特征納入預(yù)后預(yù)測(cè)模型的重要性。

參考資料：

1. Immunogenomic Landscape of Hematological Malignancies. Cancer Cell, 2020, DOI:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.06.002

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30275-0

2.Study Spells Out Immune, Genomic, Epigenomic Interactions in Hematological Malignancies

https://www.genomeweb.com/sequencing/study-spells-out-immune-genomic-epigenomic-interactions-hematological-malignancies#.Xwu2njMpj2c